Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms