Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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