Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms