Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1aQ9JLR9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms