Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc5a3Q9JKZ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc5a3Q9JKZ2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms