Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms