Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms