Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bco1Q9JJS6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms