Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a3Q9JHW9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms