Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms