Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa13Q9ERS2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms