Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv4Q9EPK8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms