Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc97Q9DBT3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms