Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift46Q9DB07 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift46Q9DB07 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift46Q9DB07 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift46Q9DB07 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift46Q9DB07 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift46Q9DB07 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift46Q9DB07 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift46Q9DB07 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift46Q9DB07 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift46Q9DB07 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms