Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf4Q9DAW6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms