Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms