Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D8Q6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms