Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc52a2Q9D8F3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms