Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms