Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vstm5Q9D806 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vstm5Q9D806 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms