Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cldn22Q9D7U6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn22Q9D7U6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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