Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms