Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms