Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam227bQ9D518 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms