Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc130Q9D516 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms