Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms