Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
4933428G20RikQ9D3X4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms