Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd2Q9D3B1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms