Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy3Q9D394 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms