Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc6bQ9D289 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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