Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms