Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms