Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem53Q9D0Z3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms