Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2e1Q9D0D5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms