Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Prelid3bQ9CYY7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prelid3bQ9CYY7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms