Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zcchc8Q9CYA6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zcchc8Q9CYA6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms