Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssu72Q9CY97 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms