Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bud23Q9CY21 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bud23Q9CY21 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bud23Q9CY21 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bud23Q9CY21 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bud23Q9CY21 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bud23Q9CY21 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Bud23Q9CY21 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Bud23Q9CY21 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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