Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Sgo1Q9CXH7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Sgo1Q9CXH7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Sgo1Q9CXH7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Sgo1Q9CXH7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sgo1Q9CXH7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Sgo1Q9CXH7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Sgo1Q9CXH7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Sgo1Q9CXH7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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