Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Xrcc3Q9CXE6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Xrcc3Q9CXE6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Xrcc3Q9CXE6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Xrcc3Q9CXE6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Xrcc3Q9CXE6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Xrcc3Q9CXE6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Xrcc3Q9CXE6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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