Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufaf1Q9CWX2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufaf1Q9CWX2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms