Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ddx28Q9CWT6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx28Q9CWT6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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