Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc3Q9CW03 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms