Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd3Q9CRB9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd3Q9CRB9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms