Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msmo1Q9CRA4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msmo1Q9CRA4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms