Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl28Q9CR40 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms