Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Nicn1Q9CQM0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nicn1Q9CQM0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms