Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms