Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms