Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl17Q9CPR4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms